Чистокровные животные обычно выращиваются в маленьких группах, и их селекция, начиная с рождения, направлена на характеристики породы. Поэтому эти породы могут составлять интересный генофонд (совокупность наследственных факторов популяции) с большим потенциалом для улучшения местных популяций. Большинство кроликов выращиваемых для промышленного производства мяса, принадлежат к популяциям, которые могут напоминать ту или иную породу (это объясняется тем, что местные кролиководы не встречали критерии оценки той или иной специфической породы в стандартах пород) или иногда не напоминают ни одну из существующих стандартных породу. Это "обычные" кролики, серые, разноцветные или белые, результат различных незапланированных скрещиваний. Они могут принадлежать к местным популяциям. Несколько примеров местных популяций в развивающихся странах - кролик Балади в Судане (baladi, в переводе с арабского – аборигенный, или местный), Мальтийский кролик в Тунисе, Креольский кролик в Гваделупе. Развивающиеся страны, планирующие развивать промышленное производство кролика должны сначала идентифицировать существующие местные популяции и установить их биологические особенности и особенности размножения, а также адаптируемость до вступления в силу селекционных программ и улучшенных систем производства. Многие страны, где выращиванием кроликов занимаются не так давно, порядка несколько десятилетий, имеют не четко определенные местные популяции. Популяции высоко полиморфичны и получены от очень многих незапланированных скрещиваний с импортированными чистокровными животными. Часто эти популяции имеют ограниченный потенциал и не приспособлены к местным условиям. Даже в этом случае, они должны быть изучены, даже если принято решение устранить их. Наконец, существуют линии кроликов. Линия - не многочисленная генетически закрытая группа, воспроизводимая внутри себя, т.е. без применения скрещиваний извне, на протяжении нескольких поколений. Характеристики линии: количество животных участвовавших в создании линии, количество лет выведения и метод по которому группа была составлена, и возможно программа спариваний (селекция или ее отсутствие). Эти линии могут быть найдены в научно-исследовательских лабораториях, которые продолжают изучать их биологические характеристики и характеристики размножения, чтобы сделать их лучше для использования в целях селекции. Центр INRA в Тулузе сосредоточен на селекционных экспериментах с линиями (табл. 28). Частные селекционеры довольно недавно начали селекционировать линии кроликов, подобно линиям селекции домашней птицы, селекция которых были осуществлена еще с 1930. Но некоторые селекционеры или небольшие группы селекционеров, на деревенском уровне сами того не осознавая, создали линии. Некоторые научно-исследовательские лаборатории, типа Лаборатории Джексона в Бар Гарборе, штат Мэн, Соединенные Штаты, содержат инбредные линии кроликов или линии для использования исключительно в качестве лабораторных животных. Селекционеры в районах традиционно выращивающих кроликов используют местные популяции. Генетическое наследие популяции сформировано местной экологией, характерной системой производства и вмешательствами кролиководов. Постепенно, популяция развивается. За исключением определенных случаев, популяция открыта для приграничных популяций. Это замедляет тенденцию достижения однородности и оставляет возможность введения новой генетической изменчивости для естественной и/или искусственной селекции. Следующая стадия развития – порода. Здесь селекционер более важен, поскольку он определяет стандарт породы, и методом отбора и подбора животных стремится к соответствию стандарта. Экология региона и характеристики производственной системы в меньшей степени влияют на популяцию, а породы обычно более однородны по этим критериям. Стремление селекции приблизиться к идеальному стандарту породы может привести к выходу за пределы допустимого. Для достижения цели селекционеры могут оценивать только внешние признаки, пренебрегая показателями продуктивности. Они могут применять скрещивания между близкими родственниками, чтобы увеличить визуальное впечатление от однородности. Последний эволюционный уровень - линия. Она имеет меньшее количество потомков (несколько дюжин каждого пола) и небольшое количество генов заимствованных у смежных популяций. Линия обычно искусственно селекционируется по нескольким параметрам. Часто линии генетически более однородны, чем породы.